《间谍一家亲》围绕着特工黄昏、杀手约尔和超能力少女阿尼亚这一特殊家庭展开。黄昏代号“企鹅”，为完成秘密任务“枭”计划，需组建家庭让孩子进入名校伊甸学园接近目标人物。他收养了拥有读心术的阿尼亚，又机缘巧合与约尔组成假夫妻。阿尼亚能读取他人心思，常因获取到的信息闹出笑话。约尔虽是温柔的职场女性，实则是冷酷杀手“荆棘公主”。在相处中，这个看似怪异的家庭逐渐有了家的温暖。他们在校园活动、日常生活中不断化解危机，有温馨的互动，也有惊险刺激的间谍与杀手情节，充满了欢乐与温情。