《731大溃逃》聚焦于侵华日军臭名昭著的731部队。随着战争局势的逐渐不利，731部队自知末日将至，开始了一场慌乱的大溃逃。在溃逃过程中，他们妄图销毁一切有关细菌战、人体实验等暴行的证据，以掩盖其反人类的罪行。 影片中展现了731部队成员的惊恐与疯狂，他们在销毁资料、屠杀实验对象等一系列罪恶行径中尽显丑恶嘴脸。同时，也刻画了一些觉醒的内部人员，他们对部队的暴行感到愧疚和愤怒，试图将真相传递出去。而当地百姓在经历了731部队长期的迫害后，也在暗中反抗，与这些恶魔展开了激烈的斗争，最终让部分真相得以重见天日，揭示了日本军国主义的残暴与黑暗。