《神奇动物在哪里》故事设定在 20 世纪 20 年代的纽约。魔法动物学家纽特·斯卡曼德带着他装有无数神奇动物的魔法皮箱来到这里。然而，箱子意外打开，一些神奇动物逃脱到纽约城。与此同时，纽约正面临着神秘的黑魔法威胁，一种被称为“默默然”的邪恶力量在作祟。麻鸡（不会魔法的人）雅各布意外与纽特结识，并被卷入这场魔法风波。纽特和美国魔法国会女傲罗蒂娜·戈德斯坦恩一起，踏上寻找逃脱动物、揭开黑魔法真相的冒险之旅。他们在纽约的大街小巷穿梭，与各种神奇动物和危险魔法势力斗智斗勇，过程中不仅要应对动物带来的麻烦，还要面对来自魔法国会的怀疑和追捕。最终，他们能否成功找回动物、破解黑魔法谜团，守护纽约城的魔法与和平呢？