《青之驱魔师》围绕着奥村磷展开，他表面是普通少年，实则是魔神撒旦之子。在养父藤本狮郎为保护他牺牲后，磷得知自己的身世，决定成为驱魔师，向撒旦复仇。他与双胞胎弟弟奥村雪男一同进入正十字学园驱魔师养成班学习。在学园里，磷结识了众多伙伴，如立志成为驱魔师的神木出云、拥有强大灵力的志摩廉造等。他们在学习过程中不断成长，也遭遇了各种恶魔的袭击。随着剧情发展，磷逐渐掌握自身的恶魔之力，在与恶魔的战斗中发挥重要作用。而雪男因内心的矛盾与挣扎，也有着复杂的成长历程。他们在驱魔的道路上，不断面对挑战，也在友情与亲情的支持下，努力守护人类世界。