《X战警：逆转未来》的故事设定在未来世界，变种人面临着前所未有的危机。由玻利瓦尔·特拉斯克所发明的“哨兵”机器人，能够根据变种人的能力进行自我进化，对变种人展开残酷猎杀，人类与变种人的战争一触即发，变种人几近灭绝。为了改变这一绝望的未来，X教授、万磁王与金刚狼达成合作。金刚狼的意识被送回1973年，他要阻止特拉斯克与魔形女的接触，避免“哨兵”计划的启动。回到过去的金刚狼，在X教授和年轻万磁王的帮助下，一边要应对各种突发状况，一边还要在复杂的局势中找到阻止悲剧发生的方法。最终，他们成功改变历史，让未来走向了不同的方向。