《鼹鼠之歌》以刑警菊川玲二为主角展开故事。菊川玲二是个行事风格独特的刑警，他被上司安排潜入黑帮组织鸿池组。初入黑帮，他凭借自己的机灵和大胆，逐渐在鸿池组站稳脚跟。在黑帮的日子里，他一边要完成警方交代的任务，收集黑帮犯罪证据，一边又要应对黑帮内部的各种争斗和猜疑。他与黑帮成员们经历了诸多事件，有惊险的火拼场面，也有搞笑的日常相处。随着时间推移，他在黑帮中的地位不断提升，但同时也面临着身份暴露的巨大风险。最终，在一场关乎黑帮命运的关键对决中，菊川玲二凭借自己的智慧和勇气，成功完成任务，捣毁了鸿池组，同时也证明了自己作为刑警的价值。