《不要欺负我，长瀞同学》围绕着性格内向的男主石井和外表可爱却爱捉弄人的长瀞同学展开。石井在校园里总是独来独往，而长瀞同学偶然发现了他容易害羞的特点后，便开启了对他的“欺负”日常。她会在图书馆故意凑近石井，看他脸红心跳；在放学路上突然拉住石井的手，让他不知所措。然而，随着相处的深入，两人之间的互动逐渐有了别样的氛围。长瀞同学的“欺负”不再只是单纯的捉弄，石井也在一次次的“被欺负”中，对长瀞同学产生了特殊的感情。他们在校园生活的点滴互动中，上演着既搞笑又温馨的青春故事。