《锦鲤萌宝大闹督军府》围绕着可爱机灵的萌宝展开。萌宝拥有锦鲤体质，所到之处总会带来意想不到的好运与趣事。督军府中，督军严肃刻板，管理着府中的大小事务。萌宝误打误撞进入了督军府，他的天真无邪与督军的不苟言笑形成了鲜明对比。萌宝在府里四处捣乱，把督军府搅得鸡飞狗跳。他会偷偷放走督军心爱的鸟，也会在督军重要的文件上涂鸦。然而，随着相处，督军逐渐被萌宝的纯真所打动，开始接纳这个小家伙。萌宝也利用自己的锦鲤体质，帮助督军解决了不少难题，府中的气氛也变得温馨起来。