《小黄人大眼萌》将故事回溯到上世纪 60 年代，聚焦小黄人们的起源。小黄人作为一种单细胞生物进化而来的黄色生物，一直致力于寻找强大的主人。它们先后侍奉过霸王龙、吸血鬼等，但都以失败告终，导致族群陷入迷茫。后来，凯文、斯图尔特、鲍勃三个小黄人决定踏上寻找新主人的旅程。他们来到纽约，又辗转到奥兰多，最终在坏蛋大会上，被野心勃勃的斯嘉丽·杀人狂吸引。斯嘉丽承诺带他们走向辉煌，小黄人们便成为她的手下。然而，在盗取英国女王皇冠的任务中状况百出，引发一系列搞笑又惊险的故事。小黄人们在冒险中不断成长，也收获了真挚的友情。