在《金田一少年事件簿：黑魔术杀人事件 后篇》中，神秘的黑魔术杀人案件进入关键阶段。金田一和美雪继续深入调查，面对重重迷雾和接连不断的诡异命案，他们承受着巨大压力。凶手似乎知晓他们的行动，不断设下新的陷阱。在调查过程中，新的嫌疑人浮出水面，每个人都有着不为人知的秘密和动机。随着线索逐渐汇聚，金田一终于发现了隐藏在黑魔术背后的真相。原来这一系列命案与多年前的一起事件有关，凶手是为了复仇而精心策划了这一切。最终，金田一凭借智慧和勇气揭开了凶手的真面目，让真相大白于天下，也为受害者讨回了公道。